Alaplı/Zonguldak doğumlu Dr. Aydoğdu, Kabataş Erkek Lisesi ve Selçuk Üniversitesi Tıp Fakültesi mezunudur. Uzmanlığını Çukurova Üniversitesi Tıp Fakültesi Çocuk Cerrahisi Anabilim Dalı’nda tamamlamıştır.
Sırasıyla SSK Karadeniz Ereğli Hastanesi, Zonguldak Atatürk Devlet Hastanesi, Zonguldak Kadın Doğum ve Çocuk Hastalıkları Hastanesi ve İstanbul Okmeydanı Eğitim ve Araştırma Hastanesinde görev yapmıştır. Sağlık Bakanlığı, Ulusal Medikal Kurtarma Ekibi (UMKE) ve Yeryüzü Doktorları ile yurt içi ve yurt dışında görevler almıştır. Ayrıca UMKE ve Palyatif Bakım eğiticisidir. 2013 yılından beri Bezmiâlem Vakıf Üniversitesi Tıp Fakültesi Çocuk Cerrahisi Anabilim Dalı’nda çalışmaktadır. İstanbul Bilim Üniversitesi Şişli Florence Nightingale Hastanesi Böbrek Nakli Merkezinde 2018 yılında tam zamanlı altı aylık eğitim almıştır. Bezmiâlem Vakıf Üniversitesi’nde Böbrek Nakli Birimi ve Palyatif Bakım ekibinin de üyesidir.